如何用VASPKIT自动提交作业

本文共有1046个字,关键词:VASPKIT

第一步:从how_to_set_environment_variables文件中拷贝以下内容至~/.vaspkit文件

#BEGIN_CUSTOMIZE_JOB_SCRIPT

#PBS -N name     
#PBS -o out
#PBS -e err
#PBS -l nodes=2:ppn=4
cd $PBS_O_WORKDIR
mpirun -np 8 vasp_std > vasp-out

#END_CUSTOMIZE_JOB_SCRIPT

#BEGIN_CUSTOMIZE_JOB_SCRIPT#END_CUSTOMIZE_JOB_SCRIPT内容为作业提交命令,用自己使用的超算作业脚本替换掉这部分内容

第二步:在~/.vaspkit中设置

AUTO_SUBMIT_JOB               .TRUE.         是否自动提交作业
SUBMIT_JOB_COMMAND            'qsub job.sh'  提交作业命令格式

如果设置AUTO_SUBMIT_JOB = T,VASPKIT在执行任务完成后会自动提交作业,适合批处理,如计算弹性常数。也可通过vaspkit –task 109提交作业

如果您使用VASPKIT,请记得引用哦!

V. Wang, N. Xu, J.-C. Liu, G. Tang, W.-T. Geng, VASPKIT: A User-Friendly Interface Facilitating High-Throughput Computing and Analysis Using VASP Code, Computer Physics Communications 267, 108033, (2021), https://doi.org/10.1016/j.cpc.2021.108033

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